Паспорт безопасности для морского и внутреннего водного транспорта включает 10 приложений организационно-распорядительных документов: обследование, схемы, оргструктура, перечни, правила, порядки. Правила, обеспечивающие реализацию порядка должны быть согласованы с уполномоченными подразделениями ФСБ, МВД.